Portofino est située au fond du promontoire de Portofino à 36 km de Gênes.
Portofino est à l'intérieur du Parc naturel régional de Portofino avec 6 autres communes.
Selon Pline l'Ancien, Portofino fut fondée par les Romains et nommée Portus Delphini à cause du grand nombre de dauphins dans le golfe de Tigullio.
Pendant le Moyen Âge, le port naturel de Portofino servait de refuge pour la marine marchande de la République de Gênes.
Le Congrès de Vienne (1815) attribua le territoire communal (ainsi que la République de Gênes) au Royaume de Sardaigne.