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La mosaïque de la Déisis date probablement de 1261. C'est le troisième panneau de la loge impériale de la galerie supérieure. Cette mosaïque est considérée comme un chef d'œuvre pour la douceur des traits et de l'expression des visages, et aussi comme le début de la renaissance de l'art pictural byzantin. Le style est celui des peintres italiens des fin XIIIe-XIVe siècles, comme Duccio. La Vierge Marie et Jean-Baptiste, tous deux de trois-quarts, implorent l'intercession du Christ Pantocrator pour les péchés de l'humanité lors du Jugement dernier. La partie inférieure de la mosaïque est très détériorée, probablement à cause de la pluie venant de la fenêtre voisine.
La déisis est un thème chrétien fréquemment représenté dans l'art.
La Vierge et saint Jean-Baptiste sont représentés de part et d'autre du Christ et prient pour le salut des chrétiens. Cette iconographie est particulièrement présente dans l'art byzantin. Il en est une magnifique représentation à la basilique Sainte-Sophie (Constantinople), chef d'œuvre des mosaïques byzantines.