Une bulle pontificale de Lucius III condamne les diverses formes d'hérésie : Cathares, Vaudois, Patarins, etc.
Le pape Lucius se réfugie à Vérone face à la commune de Rome. Il y réunit un concile qui condamne les néo-manichéens (Cathares) contre qui il institue l’Inquisition épiscopale. Le prédicateur lyonnais Pierre Valdès est excommunié. Il continue cependant à prêcher en accentuant son hostilité à la hiérarchie catholique. Une partie des Vaudois s’établit dans le Sud de la France, s’oppose aux Cathares et sera récupérée par la prédication de saint Dominique. Une autre fraction passe en Italie puis en Europe centrale et sera pourchassée par l’autorité ecclésiastique.