Steve Rogers, plus connu sous le nom de Captain America, s'est adapté tant bien que mal à son nouvel environnement, et poursuit ses missions en tant qu'agent du S.H.I.E.L.D., l'agence militaire chargée d'assurer l'ordre international. Mais une organisation secrète aux desseins maléfiques a réussi à infiltrer le S.H.I.E.L.D. qu'elle gangrène de l'intérieur.